LABORATORIO DI GENETICA MEDICA E BIOTECNOLOGIE FORENSI

Anno accademico 2021/2022 - 1° anno - Curriculum BIOTECNOLOGIE MEDICHE
Docenti Crediti: 6
Organizzazione didattica: 150 ore d'impegno totale, 0 di studio individuale, 150 di laboratorio
Semestre:
ENGLISH VERSION

Obiettivi formativi

  • LABORATORIO DI GENETICA MEDICA

    Alla fine del corso gli studenti devono essere in grado di:

    Descrivere la struttura del gene e conoscere i principali meccanismi di regolazione dell'espressione genica, i tipi di variazioni genetiche e genomiche del genoma umano e spiegare il loro ruolo nello stato patologico e nella diversità fenotipica. Conoscere i vari metodi d'indagine genetica e genomica sia a livello tecnico che bioinformatico, con particolar riguardo all'analisi delle varianti strutturali genomiche tramite l'uso delle tecniche di microarray a DNA e whole genome sequencing nonché l'uso della whole exome sequencing nell'analisi della parte codificante del genoma. Apprendere l'utilizzo delle tecniche di RNA-seq nello studio dell'espressione genica e la loro utilità nello studio dei modelli complessi. Utilizzare le principali banche dati genomiche, trascrittomiche e di genetica medica. Conoscere le principali applicazioni dell’ingegneria genetica in medicina

  • LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI

    Lo studente frequenterà l'U.O. di Medicina Legale per acquisire competenze in ambito specialistico, imparando i principi generali della medicina legale e della pratica forense.


Modalità di svolgimento dell'insegnamento

  • LABORATORIO DI GENETICA MEDICA

    Lezioni frontali ed esercitazioni pratiche

    Qualora l'insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto dichiarato in precedenza, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel syllabus.

  • LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI

    Frequenza reparti e ambulatori in affiancamento al personale medico.

    Qualora l'insegnamento venisse impartito in modalità mista o a distanza potranno essere introdotte le necessarie variazioni rispetto a quanto dichiarato in precedenza, al fine di rispettare il programma previsto e riportato nel Syllabus.


Prerequisiti richiesti

  • LABORATORIO DI GENETICA MEDICA

    Principi di genetica umana e Genetica Medica, basi di statistica e probabilità

  • LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI

    Corso di informazione obbligatorio, nulla osta sorveglianza sanitaria, vaccino anti-COVID19. Frequenza del Tirocinio di III anno.


Frequenza lezioni

  • LABORATORIO DI GENETICA MEDICA

    almeno il 70% delle lezioni

  • LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI

    Obbligatoria.


Contenuti del corso

  • LABORATORIO DI GENETICA MEDICA
    1. Struttura del gene e regolazione dell’espressione genica
      1. Geni codificanti e non codificanti
      2. Promotori, enhancers e fattori di trascrizione
      3. Principi di epigenetica
      4. Splicing alternativi
      5. Trascritti non codificanti e antisenso
      6. RNA interference
      7. Struttura del genoma
      8. Il genoma 3D
      9. Banche dati genomiche

    2.Tecniche di analisi whole genome e di espressione
    1. Microarray a DNA
    2. Tecniche Genome wide association nelle malattie complesse
    3. Techniche NGS
    4. Whole exome sequencing
    5. Whole genome sequencing
    6. Bioinformatica dell’analisi di dati NGS
    7. Analisi del trascrittoma tramite RNA-seq

    3.Ingegneria genetica in medicina

    1. Topi transgenici e topi knock-out
    2. Gene targeting e mutagenesi condizionale
    3. Il sistema CRISPR/Cas9
    4. Applicazioni in terapia genica

  • LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI

    Il tirocinante dovrà acquisire le seguenti conoscenze e competenze:

    • Sapere come si redige in maniera corretta la documentazione sanitaria
    • Sapere come si effettua una diagnosi di morte e come se ne denunciano le cause
    • Conoscere le principali metodiche di laboratorio utilizzate in tossicologia forense

Testi di riferimento

  • LABORATORIO DI GENETICA MEDICA

    Human Molecular Genetics (English Edition) 5° Edizione , Garland Science

    Genetica Umana e Medica (Neri, Genuardi), seconda edizione, Elsevier

    Medical Genetics (Jorde, Carey, Bamshad) fifth edition, Elsevier

    RNA-seq Data Analysis: A Practical Approach CRC press

    Computational exome and genome analysis

  • LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI

    Materiale didattico fornito dai tutor.


Programmazione del corso

LABORATORIO DI GENETICA MEDICA
 ArgomentiRiferimenti testi
1Struttura del gene e regolazione dell’espressione genicaSlides fornite dal docente / Neri Genuardi capitolo 1 / Human Molecular Genetics capitolo 10 
2Tecniche di analisi whole genome e di espressioneSlides fornite dal docente / Neri Genuardi capitolo 6 / Human Molecular Genetics capitolo 17 
3Ingegneria genetica in medicinaSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 15,16,17/Human Molecular Genetics capitolo 22 
4Geni codificanti e non codificantiSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 1 pag 81 
5Promotori, enhancers e fattori di trascrizioneSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 1 pag 72 
6Principi di epigeneticaSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 1 pag 61 
7Splicing alternativi e spliceosomaSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 1 pag 78 
8Trascritti non codificanti e antisensoSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 1 pag 83 
9RNA interferenceSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 1 pag 83 
10Struttura del genomaSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 1 pag 90 
11Il genoma 3DSlides fornite dal docente 
12Banche dati genomicheSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 1 pag 87 
13Microarray a DNASlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 4 pag 204 
14Tecniche Genome wide association nelle malattie complesseSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 9 pag 455 
15Tecniche NGSSlides fornite dal docente / Comp. exome and genome.. capitolo 2-9  
16Whole exome sequencingSlides fornite dal docente / Comp. exome and genome.. capitolo 24-28 
17Whole genome sequencingSlides fornite dal docente / Comp. exome and genome.. capitolo 19 
18Bioinformatica dell’analisi di dati NGSlides fornite dal docente / Comp. exome and genome.. capitolo 24-28 
19Analisi del trascrittoma tramite RNA-seqSlides fornite dal docente / RNA-seq Data Analysis: A Practical Approach Capitolo 1-2-4 
20Topi transgenici e topi knock-outSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 12 pag 587 
21Gene targeting e mutagenesi condizionaleSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 12 pag 590 
22Il sistema CRISPR/Cas9Slides fornite dal docente 
23Applicazioni in terapia genicaSlides fornite dal docente /Neri Genuardi capitolo 12 /Human Molecular Genetics capitolo 8g 598 
LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI
 ArgomentiRiferimenti testi
1programma didattico in totoNORELLI G.A., BUCCELLI C., FINESCHI V., Medicina Legale e delle Assicurazioni, Piccin, Padova, II EDIZIONE. 

Verifica dell'apprendimento

Modalità di verifica dell'apprendimento

  • LABORATORIO DI GENETICA MEDICA

    Esame orale

    La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica, qualora le condizioni lo dovessero richiedere.

    Learning assessment may also be carried out on line, should the conditions require it.

  • LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI

    Verifica mediante interazione diretta con i tutor durante la frequenza del reparto.

     

    La verifica dell’apprendimento potrà essere effettuata anche per via telematica, qualora le condizioni lo dovessero richiedere


Esempi di domande e/o esercizi frequenti

  • LABORATORIO DI GENETICA MEDICA

    -Regolazione dell'espressione genica

    - I topological associated domains (TAD).

    - Signature in whole genome sequence delle inversioni genomiche

    - Prioritizazzione delle varianti candidate

    - Geni non codificanti

    - Malattie da difetti dell'imprinting

    - Principio degli studi genome wide association

    - Incidental findings nella refertazione WES

    - Metodi di variant calling

    -

  • LABORATORIO DI BIOTECNOLOGIE FORENSI

    Il tutor valuterà le competenze acquisite (sapere e sapere fare) dal tirocinante in relazione agli obiettivi previsti e compilerà la scheda di valutazione predisposta dalla Commissione Tirocini del CdL.