BIOLOGIA, GENOMICA, GENETICA UMANA E MEDICA

Obiettivi formativi

• GENETICA MEDICA

  Alla fine del corso gli studenti devono essere in grado di:

  Descrivere i tipi di variazioni genetiche e genomiche del genoma umano e spiegare il loro ruolo nello stato patologico e nella diversità fenotipica. Effettuare l’analisi del pedigree e comprendere I principi dell’ereditarietà, per calcolare il rischio genetico in una varietà di malattie genetiche e modi di trasmissione diversi. Incorporare le nozioni di genetica di popolazione per il calcolo del rischio genetico basato sulla frequenza allelica nella popolazione. Conoscere i meccanismi non mendeliani quali penetranza ridotta ed espressività variabile, disomia uniparentale, mosaicismi, imprinting e malattie da espansione da triplette Conoscere i principi della consulenza genetica e. Gli studenti dovranno inoltre essere in grado di comprendere le modalità tecniche di esecuzione nonché d’interpretazione dei principali test genetici quali array-CGH/SNP e NGS, conoscerne le loro sensibilità e specificità cliniche ed analitche e i loro valori predittivi.

Frequenza lezioni

• GENETICA MEDICA

  almeno il 70% delle lezioni

Contenuti del corso

• GENETICA MEDICA

  Variazioni genetiche, genomiche e loro cause Concetto di polimorfismo e mutazione e loro significato evoluzionistico Mutazioni costituzionali e somatiche Equilibrio di Hardy-Weinberg e sue deviazioni Effetto fondatore e deriva genetica Markers polimorfici, aplotipi e analisi di linkage Principali meccanismi d’insorgenza delle variazioni genetiche e genomiche Sistemi di riparazione del DNA Classificazione funzionale delle mutazioni Modalità di trasmissione delle malattie genetiche mendeliane e legate al sesso Concetto di allele recessivo, dominante e legato ai cromosomi sessuali Ereditarietà pseudodominante e digenica Penetranza ed espressività Mosaicismo Imprinting genomico Malattie da ripetizioni di triplette e anticipazione Altri tipi di ereditarietà Ereditarietà mitocondriale Ereditarietà poligenica e multifattoriale Modelli di malattie multifattoriali Genetica delle malattie complesse Le basi cromosomiche delle malattie genetiche Anomalie del numero di cromosomi e non disgiunzione meiotica Sindrome di Turner, Sindrome di Down, Sindrome di Edwards, Sindrome di Patau Anomalie di struttura Traslocazioni, inversioni, delezioni duplicazioni Plasticità del genoma umano: le copy number variants Meccanismi di formazione delle copy number variants Disomia Uniparentale Trisomic e monosomic rescue Tecniche di analisi dell’assetto cromosomico Cariotipo FISH Array-CGH e SNP-array Test genetici Concetti di Sensibilità e specificità dei test Probabilità bayesiana e valori predittivi Array-CGH e SNP-array Analisi statistica del segnale Consultazione dei databases Next generation sequencing (NGS) Metodologia e relativi indicatori Base calling Phred score, coverage e distribuzione binomiale delle reads Algoritmi per il genotype calling Metodi a soglia fissa e metodi bayesiani Gene Panel, WES e WGS Workflow diagnostico e software di previsione delle varianti Indicatori diagnostici della NGS Refertazione e incidental findings nella NGS   La consulenza genetica Definizioni e principi Rischio di ricorrenza

Testi di riferimento

• GENETICA MEDICA

  Genetica Umana e Medica (Neri, Genuardi), seconda edizione, Elsevier

  Medical Genetics (Jorde, Carey, Bamshad) fifth edition, Elsevier